临床辅助系统是以浮窗插件的形式集成到医生工作站。
通过与医院信息化系统之间的数据互通，可以实时对患者病情做出分析。在医生使用工作站系统工作时，可以实时提供推荐服务和质控服务。其中辅助诊疗的功能包括，基于患者病情给出疑似疾病，以及需要做的检查检验项目，同时在有初步诊断时，可以提供适应的评估表、治疗方案。而且在发现医生给出的药品、检查、检验申请与患者信息有危险因素存在时，及时提醒医生。病历质控会依据病历书写规范要求，对已写的病历做验证，有问题及时提出。
在实际医院部署后，信息录入页面可以是HIS、EMR等系统。临床辅助系统以浮窗的形式展现在这些系统之上。
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